肾结石血尿并不一定会疼痛，这取决于结石的大小和位置以及身体的反应。
如果结石在肾盂内，结石比较大，活动后结石与肾盂黏膜摩擦，损伤肾盂的毛细血管，就会出现血尿。这种情况下，虽然会出现血尿，但一般不会出现疼痛。这是因为肾盂是尿液的储存和排放区域，肾结石在这里形成后，通常不会对身体造成太大的影响，而且肾盂内的结石比较大，所以也不会对身体造成直接的伤害。
然而，如果结石由肾脏排到输尿管，在输尿管不停的移动，损伤输尿管黏膜，这种情况下有血尿就有明显的疼痛，主要就是肾绞痛。这是因为输尿管是尿液通过的地方，当结石移动到这里时，会对输尿管黏膜造成损伤，导致疼痛和不适。
因此，肾结石血尿并不一定会疼痛，但如果出现血尿并伴随着疼痛，需要注意及时进行检查和治疗，以避免对肾脏造成更大的伤害。