较小而无症状的囊肿可不必治疗，较大的囊肿或有症状的小囊肿可用手术治疗。经尿道电切除囊肿则是手术途径，但是对于年轻的，保留精阜对正常射精至关重要。当持续高烧不退，尿路症状无明显改善，尿道溢脓，大便不畅时，应考虑前列腺囊肿的可能，借助B超等检查确诊后行脓肿切开引流或穿刺引流治疗。只有当脓肿彻底消灭之后，以上症状才会缓解。