肉芽肿性前列腺炎的治疗，局部及全身感染严重者需抗感染治疗，通常1~3周可以控制症状。若继发于特异性感染，应针对病原菌予以治疗，治疗包括药物、局部理疗和手术等。根据不同病因，应用抗生素、抗组织胺、抗结核、类固醇激素及免疫抑制剂等药物。