肉芽肿性前列腺炎的发病与局部强烈的异物反应有关。前列腺导管阻塞是首要因素，原因包括细菌感染引发的炎症过程或外科创伤造成的组织坏死，前列腺增生也可能造成或加重前列腺导管的梗阻。肉芽肿性炎症可能是局限的，也可能累及整个前列腺。炎症缓解慢，约需2～3个月的时间，局部被纤维结缔组织替代，质地发生变化。