畸形精子症并不一定会导致胎儿畸形。精子畸形率越高，导致许多男性不育的可能性也越高，意味着受孕机率的降低，但与胎儿畸形并无明确相关性。因为女性生殖道有优胜劣汰的功能，精子在穿过女性生殖道的过程中会将大部分畸形精子淘汰掉，从而排除了畸形精子和卵子结合的可能，最终保证受孕的精子的质量。