隐睾手术肯定有后遗症，最常见的就是伤口感染和血肿，部分病患可能会有睾丸萎缩，睾丸萎缩发生率大约5%-10%，这种后遗症的发生与隐睾的严重程度有关，对于很多腹膜后的隐睾，特别是不能摸到的隐睾或者是发育明显偏小的隐睾，手术后睾丸萎缩发生的概率比较大。一些腹股沟区多次手术的，手术后睾丸萎缩的可能性也比较大。