肾脓肿的治疗费用在1万-3万元左右，肾囊肿的手术费用不可一概而论，因为各个地区、各个医院的收费标准不一样，没有固定的数值。但一般而言，肾囊肿手术都是采用微创的手术方法，需要通过腹腔镜手术，行腹腔镜下的肾囊肿去顶减压术。这种微创手术费用一般比较高，在二甲医院一般在1万元左右，三甲医院费用可能更高一些，在1-2万元左右。肾囊肿最大径超过5cm的时候，应该到医院就诊，进行手术治疗。