前列腺囊肿较小而无症状的囊肿可不必治疗，较大的囊肿或有症状的小囊肿可进行手术治疗。穿刺治疗比较简单，经肛门指诊，将一根长针头刺入脓腔内，用注射器抽吸直至脓汁完全吸净。有时一次不会完全消灭，需两次或数次。当脓腔较大、脓汁较多时，以脓腔切开引流，用肛门直肠镜暴露出前列腺部位，用尖刀将直肠壁切开脓肿腔内，将脓汁引流出来放置引流管，视引流情况，结合检查再决定拔除引流管时间。当前该治疗仍需用抗生素配合治疗。