造成精子畸形的原因有：不良的生活习惯，生殖泌尿感染，也是造成畸形精子症的重要原因之一，男科疾病也是造成精子畸形率过高的一个原因，香烟当中的尼古丁以及白酒当中的酒精，染色体发生变异，导致精子畸形的发生，内分泌功能低下，即体内某些相关激素的分泌不平衡，从而造成畸形率增高。