这种疾病不容易治疗。常见治疗方式有：由生殖道感染引起者，可进行抗炎治疗；由内分泌异常所致者，则给予内分泌功能调整。治疗高畸形率精子症所致不育症应根据引起畸形精子的原因，消除不利因素(药物、放射线、高温、酒等)，针对病因进行治疗。