前列腺脓肿后期的治疗方法有以下：前列腺脓肿可以进行抗菌药治疗，根据尿液脓液的细菌培养选用抗菌药，短期可控制病情。也可以采取会阴部前列腺穿刺抽脓术，同时向脓腔注射抗生素，或者切开排脓术。也可以物理疗法，用热水袋放在会阴部做热敷，促进局部脓肿炎症消散。