一般情况下，龟头根部有疙瘩可能是尖锐湿疣造成的，具体内容如下：
尖锐湿疣会引起龟头根部长疙瘩。尖锐湿疣患者局部的疙瘩会出现明显的改变，一般不会出现疼痛、瘙痒等症状，但会随着时间的推移逐渐增大。尖锐湿疣起初为一小块，后期生长成柱状、分叶、菜花状等。尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的，与不洁性生活有一定的关系，建议在手术切除后进行抗病毒治疗。