一般情况下，轻微的肺部真菌感染不能自愈，需积极进行药物治疗。
肺部的真菌感染，主要是因为自身的一些基础疾病，导致机体抵抗力降低，或是因为服用了广谱的抗生素，或是长期服用了激素，从而导致了全身的免疫力降低。轻度的肺部真菌感染是不能治愈的，可以口服抗真菌的药物，比如氟康唑胶囊。曲霉感染可以口服伊曲康唑、伏立康唑等。如果是轻度的肺部真菌感染，需要进行胸部CT、血常规、肝肾功能等检查，避免长时间使用抗真菌药物的副作用，通常需要1-3个月或6个月。