一般情况下，男性龟头有小疱可能是疱疹病毒感染、龟头炎、过度摩擦等原因引起的。
1.疱疹病毒感染：受到疱疹病毒感染，会在龟头上形成簇状的小泡，可能导致男性龟头有小疱。小疱在破裂之后会溃烂，会伴随着明显的痛楚，疱液结疤干燥后会自己脱落，通常在七天之内就会痊愈。
2.龟头炎：龟头炎患者龟头上会有红斑、红肿等症状，还会伴随着一些小疱，容易导致男性龟头有小疱，这些小疱会化脓，同时还会伴随着一些糜烂、渗出等症状。
3.过度摩擦：龟头如果受到机械的过度摩擦，比如龟头和内裤经常摩擦，就会形成张力的水泡，从而导致男性龟头有小疱。