生殖器疱疹大多发生在皮肤和黏膜的交界处。首先，局部皮肤微微发红，然后会发出针尖大小的一簇簇小水泡。它有轻微的瘙痒和烧灼感。几天后，它变干并形成棕色结痂。结痂脱落后，有轻微的色素沉着，但也很快消失。整个病程平均为一周，但它经常复发。