生殖器疱疹最常见的症状是一簇包含有流动性液体的大水疱，破裂后会产生疼痛的溃疡，溃疡之后结痂然后自愈。过程可能会持续好几天。但是在有些人只表现为皮肤上有一些小疹子和类似丘疹的小肿块。还有些人有一些其症状像小便涩痛，在一些女性中可以表现为有阴道液体排出。