羊痘通常能自愈，但积极治疗可以缩短病程。
羊痘的治疗要遵循对症治疗，避免二次感染的原则，这种疾病通常会持续3到6个星期，而且会自行痊愈，一旦痊愈，就会产生终身的免疫能力。
在不干净的皮肤上涂上0.1%雷夫奴尔软膏，让皮肤上的瘢痕变得柔软，然后在水泡破开后，用0.1%雷夫奴尔溶液将皮肤上的瘢痕覆盖起来。可以服用利巴韦林等药物，如果有化脓性感染，可以静脉滴注青霉素。
外科手术主要是把较大的、突出的皮肤切除掉，这样可以缩短病情的时间。