去疣的治疗主要有激光和冷冻两种，两者各有利弊，并无优劣之分。
1、激光去疣：一般是利用二氧化碳激光来摧毁疣体，光斑比较小，可以直接照射，作用于皮肤，定位准确，并且具有电凝的作用，可以达到止血的效果。主要用于面、颈、腰、背等处的扁平疣、寻常疣、尖锐湿疣和少量的跖疣等，但对由隐性病毒感染引起的疣体，疗效并不明显，而且激光法会有疼痛感，容易复发的情况。
2、冷冻去疣：以液态氮为原料，以较低的温度来除去疣子。还可以治疗全身多处的良性肿瘤，如扁平疣、跖疣、尖锐湿疣、传染性软疣、脂溢性角化、疣状痣等。一般来说，它的疼痛比激光要轻微，对皮肤的伤害也比较小，不易形成瘢痕，但它的作用范围比较大，一般不能一次性治愈，必须要经过多次的治疗。