男性生殖器冠沟处有小疙瘩可能是尖锐湿疣、龟头炎等疾病引起的，需要对症治疗。
1.尖锐湿疣：尖锐湿疣主要由人乳头瘤病毒感染所致，可能会导致生殖器冠沟处有小疙瘩，建议患者在医生的指导下使用氟尿嘧啶乳膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗。
2.龟头炎：细菌、病毒、真菌、支原体等病原菌感染可能会起龟头的炎性反应，使男性出现生殖器冠沟处有小疙瘩。建议患者在医生的指导下使用克霉唑乳膏、甲硝唑片等。