一般情况下，龟头沟里有小疙瘩可能是龟头炎、尖锐湿疣等因素造成的，具体内容如下：
1.龟头炎：不注意个人卫生、包皮过长等因素可能诱发龟头炎，可能使患者龟头沟里有小疙瘩。患者应及时就诊，遵医嘱使用左氧氟沙星片、罗红霉素胶囊、红霉素软膏等药物进行治疗。
2.尖锐湿疣：不洁性行为可能导致患者感染病毒，可能诱发尖锐湿疣，使患者龟头出现赘生物，可能导致患者龟头沟里有小疙瘩。患者应及时就医，在医生指导下使用阿昔洛韦片、伐昔洛韦片等药物进行治疗，必要时可以通过冷冻治疗、激光治疗等方式来去除疣体。