阿昔洛韦对扁平疣是无效的，阿昔洛韦针对的病毒是单纯疱疹病毒，临床上可以用来治疗单纯疱疹、生殖器疱疹、带状疱疹等病毒性皮肤病。而扁平疣是由人类乳头瘤病毒感染引起的，临床上没有针对该病毒的特效药物，通常以增强免疫以及去除疣体对症治疗为主，可以用激光、液氮冷冻，及外用咪喹莫特、干扰素凝胶、酞丁安软膏等药物治疗。