HIV分为HIV-1型和HIV-2型，1型是全球主要流行株，它又分为M组，O组，N组，P组。其中的M组又细分为A~L，12个亚型。各个亚型间可以互相重组，形成重合亚型，比如CRF01_AE，CRF07_BC等。上述所有亚型均可形成重复感染，也就是所谓的交叉感染，当一个宿主同时感染多个亚型时，我们也称之为超感染。