治疗灰指甲最好的药膏可以选用盐酸阿莫罗芬搽剂，还有阿莫罗芬乳膏，萘替芬酮康唑软膏，特比萘芬乳膏等，这些药膏可以直接涂抹在指甲面上，然后用绷带进行包扎固定，这样渗透性会比较好，效果也会更理想。如果外用药物不理想，还要配合口服的抗真菌的药物治疗，肝功能正常者可以配合口服伊曲康唑胶囊，或者特比奈芬片以及氟康唑胶囊等进行治疗。