百多邦和红霉素软膏同属于皮肤科外用抗生素，但它们的有效成分不同，所对应的抗菌谱也有所区别，合理使用都可以起到很好的作用，不能简单的说哪个药好，适合自己的药永远是最好的药。
百多邦是莫匹罗星软膏的商品名，对与皮肤感染有关的各种革兰氏阳性球菌有很强的抗菌作用，对耐药金黄色葡萄球菌也有效，对某些革兰氏阴性菌有一定的抗菌作用，适用于革兰氏阳性球菌引起的皮肤感染。红霉素软膏是大环内酯类抗生素，对大多数革兰氏阳性球菌、部分革兰氏阴性菌及非典型性致病菌，如衣原体、支原体均用抗菌作用。因此，需要根据实际情况选择适合自己的药物，如果用药过程中有任何疑问，建议请教专业人士。