口腔尖锐湿疣的感染通常是由于性接触时由于采取的方式不同，使生殖器与口腔接触而被感染，最常见于生殖器和肛门。
口腔尖锐湿疣是由于感染人乳头瘤病毒引起的性传播疾病，主要感染的是黏膜低危型人乳头瘤病毒，如HPV6型、HPV11型、HPV32型、HPV34型、HPV40型、HPV42型，以及HPV43型、HPV44型、HPV54等感染生殖器，以及肛门、口咽部、食道黏膜等，主要是通过性接触传播。