板层状鱼鳞病是常染色体隐性遗传病，少数为常染色体显性遗传，故本病主要是由遗传因素引起，与基因异常有关。
板层状鱼鳞病发病与谷氨酰胺转移酶，即TGM1基因突变、缺失、插入有关，ALOXE5和 ALOX12B基因突变也可引起同样的外观。若父母双方为致病基因的携带者，则子女的患病率比父母非疾病基因的携带者要高。