1、病毒分离培养法：此法是生殖器疱疹检查的金标准，敏感性和特异性好，但对实验室条件要求较高，也较费时。医生会从皮损处取一定量的标本，接种在细胞培养基中，通过观察细胞病变来判断结果。生殖器疱疹病毒患者细胞培养为阳性。
2、抗原检测：目前最常用的快速诊断方法，包括直接免疫荧光试验、免疫酶染色和酶联免疫吸附试验。生殖器疱疹病毒患者生殖器疱疹抗原检测为阳性。
3、核酸杂交技术：可用于检测标本中疱疹病毒的核酸，其敏感性和特异性相当于抗原检测，但操作复杂，实验要求较高。
4、特异性血清抗体检测：生殖器疱疹患者的疱疹病毒特异性血清抗体检测阳性。此外，该检查还可用于检测不同生殖器疱疹型别的血清抗体，可用于复发性生殖器疱疹患者无皮损期的辅助诊断，但是不同试剂的敏感性和特异性相差较大。