狼疮性肾炎的治疗有病理类型有关系。病变轻微的蛋白尿少的可以使用羟氯喹和强的松治疗。系膜增生伴蛋白尿明显的需要使用强的松30–40毫克口服，还可以联合使用环磷酰胺。诱导缓解期可以强的松60毫克联合环磷酰胺0.6-1克静滴治疗，较重的可以血浆置换，免疫吸附，大剂量免疫球蛋白冲击。还有一些新的治疗方法如使用霉酚酸酯、他克莫司、来氟米特等。还有生物制剂及细胞疗法如利妥昔单抗、造血干细胞移植等。