阿昔洛韦和更昔洛韦都是抗病毒药物，但在抑制巨细胞病毒方面的区别是：更昔洛韦比阿昔洛韦强，在体外试验中大约是阿昔洛韦的100倍，但更昔洛韦的副作用较大，包括骨髓抑制，因此更昔洛韦多用于预防和治疗艾滋病、器官移值病人的巨细胞病毒感染等。相比之下，阿昔洛韦主要用于治疗皮肤和黏膜的感染，如带状疱疹病毒、单纯疱疹病毒。两种药物的应用范围不同，应根据医生的建议选择使用。