子宫颈囊肿通常不会导致痛经。宫颈囊肿是由慢性宫颈炎症导致宫颈局部腺管阻塞，从而形成的囊肿。宫颈属于植物神经支配，没有痛觉。痛经主要是子宫内膜剥脱过程中大量产生前列腺素，导致子宫平滑肌收缩，从而有下腹疼痛的症状。月经期盆腔慢性炎症会充血，加重水肿状态导致痛经。来月经时子宫内膜异位症也会导致出血，造成下腹疼痛。子宫畸形发育也会导致痛经。痛经跟子宫颈囊肿并无关系。