通常情况下，差两天来月经能查出怀孕。具体情况分析如下：差两天来月经也可能是怀孕导致的，建议女性去妇科做血常规检查。如果HCG值高于正常值，那么怀孕的几率会比较大。现在的验孕棒、B超、验血、尿检、阴超都能检测出怀孕。一般来说，如果确定要留下胎儿，不建议进行阴式彩超，因为阴式彩超会导致流产或者影响宝宝的发育。