甲流病毒可以引起扁桃体的炎症，但并不是所有感染甲流病毒的人都会出现扁桃体发炎的症状。扁桃体是呼吸系统的重要器官之一，其炎症可以导致患者出现发热、咳嗽、喉咙痛等症状。如果感染甲流病毒的病原体侵犯了扁桃体的局部防线，那么扁桃体炎症就可能会出现。
除了扁桃体，其他呼吸道器官也有可能感染甲流病毒，例如鼻窦炎、中耳炎等。因此，如果感染了甲流病毒，应该及时进行诊断和治疗，避免并发症的发生。此外，保持室内通风、勤洗手、佩戴口罩等预防措施也是预防甲流病毒感染的重要措施。