慢跑以后膝盖疼痛，首先要注意暂时减少活动，抬高患肢，注意肿胀的情况。可以注意如果肿胀非常严重，暂时冷敷，可以用冷毛巾用凉水冷敷。如果不是特别严重可以直接用热敷，热敷可以热水袋外面包裹毛巾，还可以烤灯。这种疼痛如果比较严重，还可以外用云南白药喷雾剂或者贴膏药。
如果仍然不能缓解，可以口服非甾体类消炎镇痛药物，比如扶他林或者塞来昔布，还可以用舒筋散寒、活血化瘀的中成药，比如用骨筋丸胶囊。如果疼痛非常严重还有肿胀，要排除韧带损伤、半月板损伤、滑膜炎积液的情况。这种情况需要检查一下核磁共振，如果积液多还需要抽液治疗。膝盖疼痛严重，再次跑步的时候需要做好热身，循序渐进活动，同时排除其他疾病，比如痛风或者关节炎引起的膝盖痛，都需要检查清楚以后再对症治疗。