急性上呼吸道的感染是鼻腔、咽或喉部急性炎症的概称，常见的病原体为病毒，少数是细菌。细菌感染可直接发生或继发于病毒感染之后，首先以溶血性链球菌为多见，其次为流感嗜血杆菌、肺炎链球菌和葡萄球菌等。急性上呼吸道感染中的普通感冒、病毒性咽炎、喉炎、疱疹性咽峡炎、咽结膜热，均是由病毒感染所导致，可以应用抗病毒药物治疗，如奥司他韦、利巴韦林等。
若没有合并细菌感染，则不需要加用抗生素类药物，其他可以使用的药物主要是对症的解热镇痛以及缓解症状。对于细菌性咽扁桃体炎，多是由于溶血性链球菌所引起，因此这个疾病可以使用抗生素进行治疗，如阿莫西林、红霉素、阿奇霉素、头孢菌素。有一些上呼吸道感染，如果治疗不及时，炎症可以波及其他器官，发生相应的症状，引起鼻窦炎、中耳炎等，此时的治疗应该需要使用抗生素进行抗炎治疗。上呼吸道感染也容易向下发展，引起支气管炎和肺炎，若出现细菌性支气管炎及肺炎，也需要使用抗生素类药物。