真菌病是由真菌感染引起的，治疗时需考虑致病真菌的种类、抗真菌药物的抗菌谱、感染的部位等因素，合理选择抗真菌药物。对于皮肤或黏膜等浅部真菌感染，以局部用药为主，可采用制霉菌素、两性霉素B、酮康唑、克霉唑当软膏、霜剂或栓剂直接作用于患处。对于系统性真菌病，可采用氟康唑、伊曲康唑、泊沙康唑等口服或静脉注射。系统性真菌感染，特别是容易反复发作的真菌感染，要完成整个抗真菌疗程。