正骨水和活络油主要治疗的疾病是不同的，两者都有一些舒筋活络的作用，但主要的作用方面还是不同的。正骨水一般用来治疗骨伤，有舒筋活络、去瘀消肿、止痛的作用，一般用于跌打损伤、扭伤、脱臼等。活络油一般用于风湿骨痛，关节痛等疾病，可以减轻患者的疼痛。在日常生活中，当出现疾病时，患者需要选择合适的药物进行治疗，不要盲目用药。