长期的咳嗽咳痰多见于慢性的肺部疾病而引起，例如：慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病、支气管扩张、支气管哮喘、上气道综合征、胃食管反流性咳嗽、嗜酸性粒细胞支气管炎。此外还可见于感染性疾病，例如慢性肺脓肿、肺结核、肺部真菌感染性病变。另外患有肺部肿瘤亦可引起慢性咳嗽咳痰，例如支气管肺癌和部分气管、支气管内良性肿瘤。