Ⅱ型呼衰可以出现肺的通气功能障碍，表现为血气分析二氧化碳分压大于50mmHg，和/或氧分压小于60mmHg。严重的Ⅱ型呼吸衰竭可以出现精神神志的异常改变，可表现为肺性脑病。患者可以有表情淡漠、神志恍惚、烦躁多动、眼结膜充血、皮肤潮红，甚至出现嗜睡昏迷，部分严重患者还有惊厥、抽搐等表现。部分Ⅱ型呼衰还可继发心、肝、肾、中枢神经系统等功能损害，而表现出相应的临床症状。