多种病毒感染可引起发烧肌肉酸痛的症状，如多种流感病毒感染导致的流行性感冒，冠状病毒感染引起的肺炎及上呼吸道感染，肠道病毒感染引起的手足口病或其它出疹性疾病等。但多种细菌感染也可引起发烧肌肉酸痛的症状，部分原虫感染、寄生虫感染等也可引起发烧肌肉酸痛。另外，有些肿瘤疾病、血液疾病等非感染性疾病也可引起发烧肌肉酸痛的症状，所以发烧肌肉酸痛不一定是病毒引起的。