肺脓肿的病因常来自上呼吸道、口腔菌或者分泌物的感染，致病菌以厌氧菌为主，同时可合并需氧及兼性厌氧菌。以下原因可以引起肺脓肿：1、吸入性肺脓肿，最常见，多为误吸口腔内分泌物导致肺部出现细菌感染引起化脓性病灶；2、膈下感染，肾周围感染，病灶穿破膈肌直接至肺导致的；3、皮肤感染、疖肿、盆腔感染，细菌可以通过血液途径传播到肺部，引起肺脓肿，常发生于肺两外周边缘；4、阿米巴性肺脓肿。