如果在支原体，衣原体感染的早期就进行治疗的话，支原体衣原体肺炎大多数一到二周的时间就可以痊愈，此时再检测病原体的话，就会出现支原体衣原体抗体阴性。如果支原体衣原体感染的时间比较久，体内会大量的存在病菌分泌的毒性物质，这些物质会不断的破坏肺部的组织，导致肺部间质化和纤维化的出现，支原体衣原体肺炎需要一个月的时间恢复。