在临床上，可以导致全血细胞减少的肺炎多为病毒性肺炎，也有可能是重症的细菌性肺炎。所以当患者因肺炎出现全血细胞减少时，需要根据致病微生物给予积极的治疗。
如果是细菌导致的肺炎，需要使用广谱的抗生素进行治疗，病毒导致的肺炎需要使用抗病毒的药物进行治疗，例如奥司他韦、更昔洛韦、阿比多尔等等。同时根据血常规的改变，必要时给予输血治疗。