反应性关节炎患者的治疗旨在减轻疼痛和炎症，最大程度地避免残疾，防止复发或进展。反应性关节炎主要是一般治疗和药物治疗，本病易反复发生及进展，因此，要长期持续性治疗。
一、一般治疗
急性发作期注意卧床休息，为避免纤维强直和肌肉萎缩，不用固定关节夹板，急性炎症症状缓解后尽早锻炼关节功能。
二、药物治疗
1、解热、镇痛、抗炎药：首选非甾体类抗炎药，包括布洛芬、吲哚美辛和塞来昔布等。虽不能改变病程，但可改善不适症状，是早期或晚期患者对症治疗的首选。
2、糖皮质激素类药物：糖皮质激素的关节腔注射，对于单关节炎或寡关节炎、肌腱末端炎有益，对于跟腱不能直接注射的滑囊炎患者应行肌肉注射，对于难度大的部位应在超声引导下进行注射，糖皮质激素全身应用的适应症，为严重的多关节炎或存在明显的房室传导阻滞。
3、改善病情的抗风湿药：对于非甾类抗炎药治疗效果不明显，以及关节症状持续3个月以上的反应性关节炎患者，可加用改善病情的抗风湿药，如甲氨蝶呤或柳氮磺吡啶，持续应用至缓解期，对于重症不缓解者可试用甲氨蝶呤联合来氟米特或环孢素治疗，也可换用硫唑嘌呤等免疫抑制剂。
4、肿瘤坏死因子(TNF)抑制剂：目前国内上市的肿瘤坏死因子抑制剂有依那西普、英夫利昔单抗、阿达木单抗，但对反应性关节炎尚缺乏有效的数据，小部分病例报道表明其可能有效。
5、抗生素：若有致病微生物的证据，适宜先使用抗菌药清除感染。对于急性沙眼衣原体感染，患者和其性伴侣均应接受推荐的治疗，以防止后期并发症的发生。不推荐广泛服用抗菌药，除非病情严重或患者年龄大或免疫功能低下。