肥大性骨关节病可分为原发性肥大性骨关节病和继发性肥大性骨关节病，前者为先天性疾病，多为常染色体显性遗传，约25%~38%有家族史，后者常继发于恶性肿瘤、心血管疾病、肺部疾病。
1、原发性肥大性骨关节病：为先天性疾病，为常染色体显性遗传，有家族史，前列腺素降解障碍，导致循环和局部微环境中的前列腺素E2水平显著增高。
2、继发性肥大性骨关节病：
（1）肺部疾病：常继发于支气管肺癌、胸膜间皮瘤、慢性肺脓肿、脓胸、支气管扩张、肺气肿、肺转移癌和肺淋巴瘤等，在支气管肺癌中以鳞状细胞癌伴有癌性空洞者出现本症多见。
（2）心血管疾病：常继发于发绀型先天性心脏病、肺源性心脏病和细菌性心内膜炎等，如法洛四联症、大动脉异位艾森曼格综合征及先天性动脉导管未闭等。
（3）胸腔外疾病：包括各种肺外恶性肿瘤并且无肺部转移者，如胰腺癌、食管癌、鼻咽癌等。另外，还有各种原因导致的肝硬化、慢性溃疡性结肠炎等。