控制哮喘、远离变应原是治疗过敏性支气管肺曲霉病的基础，在急性发作期，开采用药物治疗来稳定患者病情，减轻症状，用手术清除气道内粘液栓或痰栓。通过这些手段控制哮喘或囊性纤维化症状、阻止或治疗过敏性支气管肺曲霉病患者的肺部恶化。
一、药物治疗
1、口服糖皮质激素：是目前控制过敏性哮喘最有效的药物，激素可以有效抑制气道炎症，分为吸入、口服和静脉用药。吸入的常用药物有倍氯米松、布地奈德、氟替卡松、环索奈德等，常用的口服药物有泼尼松和泼尼松龙，静脉用药可选择琥珀酸氢化可的松。
2、抗真菌药物治疗：对于激素依赖患者或无效者，可尝试采用抗真菌药物进行治疗。
3、镇咳药物：对于阵发性咳嗽较剧烈的患者，可使用复方甘草合剂、可待因镇咳以减轻症状。
二、手术治疗
支气管镜治疗：可以通过清除患者支气管内存在的黏液栓或痰栓，控制局部炎症，使患者的肺功能得到显著改善。
三、其他治疗
吸入抗真菌药物，包括两性霉素B，有助于急性症状消退，但仍常有反复发作。