短头畸形患者总的治疗原则是手术治疗，已有多种手术方式用于短头畸形的治疗，利于微侵袭内镜手术、全颅骨重塑等，手术方式的选择应当依据多种因素，同时需根据病人具体情况选择手术时机。
一、药物治疗
甘露醇：主要成分为D-甘露糖醇，可治疗治疗颅内高压、脑水肿等。
二、手术治疗
1、一般在1岁以内发现疾病，应尽早完成颅腔的扩大和前额的改形，使脑组织得到正常发育的空间，同时重建颅额部前突的正常外形。
2、以短头畸形为主的病例，可选用Marchac的浮动骨板前移手术，手术关键是眶上骨带的重叠和单点固定，以使眶上缘和额骨板可以随额叶大脑的发育而向前移动。在额颅高耸或额部向后倾斜的病例中，可在形成眶上骨带的同时，取下其上额颅骨板，进行塑形改造，制成有正常突起弧度或前倾的颅骨板，然后重新固定在眶上骨带上。婴儿患者额顶部颅骨板成形复位后的间隙可不子植骨或固定。成年患者，塑形前移后的额颅骨板间隙可用2~3条骨板，桥样联接固定，其余间隙可不予植骨。
3、对短头畸形合并有其他颅面畸形(如Crouton综合征)的患者，手术方法变化较大，可根据术者的经验和有关的手术术式进行有机的结合和灵活运用。