急性上呼吸道感染时，约70%-80%为病毒感染。常见的致病病毒有鼻病毒、冠状病毒、腺病毒、流感和副流感病毒等，当病毒感染时，不需要应用抗生素治疗。另外20%-30%的上呼吸道感染由细菌引起，常见的细菌有链球菌、流感嗜血杆菌、葡萄球菌等，当明确有细菌感染时，可以口服抗生素治疗，阿莫西林和第一代头孢菌素比如头孢氨苄等都可以选用。