病毒疣危害性有压迫邻近组织、病情恶化等。
病毒疣会压迫邻近的组织器官，从而导致溃疡、出血，病变增大、增多，会导致局部的不适。HPV16和18型感染后，若不及时处理，很有可能会发生阴茎癌、宫颈癌等恶性疾病。还会造成交叉感染，并且会影响生育质量。同时怀孕妇女在生产过程中，会传染给婴儿，导致婴儿发生呼吸道疣。