沙眼衣原体感染可以通过以下方式进行治疗。
1、药物治疗：如果出现了沙眼衣原体，可以通过局部的抗生素来缓解眼睛不适的情况，比如新霉素眼药水、酞丁胺眼药水、利福平眼药水等。病情比较严重的话，可以在医生指导下服用阿奇霉素、红霉素等，能够有效地杀死体内的沙眼衣原体，缓解眼睛的不适。
2、手术治疗：沙眼衣原体感染后，若发生倒睫，即眼睫毛朝眼眶的位置长出来，会对眼睛产生很大的刺|激，可以通过外科的方式进行治疗，从而纠正内翻的眼睑，防止倒睫或眼内翻引起的致盲。