传染性软疣可以通过药物治疗、物理治疗等方式治疗，用药方法是局部药物和全身药物。
传染性软疣是传染性软疣病毒感染引起的，可以采取局部用药，使用维A酸乳膏、斑蝥素乳膏等药物清除皮损，还可以采取全身用药，使用西多福韦等药物静脉滴注。绝大多数患者不需静脉滴注。
患者还可以进行液氮冷冻、透热疗法等物理治疗。